https://docu.units.it/dokuwiki/ 2026-04-23T02:40:41+00:00 https://docu.units.it/dokuwiki/ https://docu.units.it/dokuwiki/_media/wiki:logo.png text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:amber?rev=1271061440&do=diff Amber 9 Installazione e configurazione scp amber9.tgz andrea@tartaglia.units.it:/home/andrea scaricato da <http://amber.scripps.edu> il file bugfix.all ed installato con: cd $AMBERHOME patch -p0 -N -r patch-rejects < bugfix.all scp bugfix.all andrea@tartaglia.units.it:/home/andrea text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:assistenza?rev=1271061440&do=diff Main page Chiamate assistenza Per chiamare l'assitenza c'è l'apposita pagina web <http://www.hp.com/support> oppure il numero telefonico 02 45279050 (che si premura di dirti subito che c'e' il servizIo WEB) L'apertura della prativa avvviene solo attraverso il serial number dalla macchina. Per la nostra installazione ė: GB8640PANX. text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:clusterfork?rev=1271061440&do=diff Main page Comando cluster-fork Questo comando, lanciato dal frontend, permette l'esecuzione di un comando su tutti i nodi. Ad esempio cluster-fork date esegue il comando date su tutti i nodi che compongono il cluster. By default, cluster-fork uses a simple series of ssh connections to launch the task serially on every compute node in the cluster. Cluster-fork is smart enough to ignore dead nodes. Usually the job is text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:considerazioni?rev=1271061440&do=diff Main Page Qualche considerazione personale La mia speranza è che queste pagine diventino un manuale di facile consultazione per affrontare la gestione del cluster, pagine che vengono via via arricchite (per il momento siamo appena all'inizio dell'inserimento di tutto quello che abbiamo raccolto in questi mesi di sofferenza). text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:docs?rev=1271061440&do=diff tartaglia.units.it Indice argomenti (in altre pagine) * Shutdown e Reboot * Gestione utenti * Comando cluster-fork * find & remove * Torque PBS MAUI * ILO * LID * Nomi Partizioni * Installazione MKL * Chiamate Assistenza * configurazione di yum * Istruzioni per l'uso di questo Wiki * About this Wiki text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:electric_fence?rev=1271061440&do=diff Electric Fence Installazione cd /prodotti wget <http://perens.com/works/software/ElectricFence/electric-fence_2.1.13-0.1.tar.gz> tar zxpvf electric-fence_2.1.13-0.1.tar.gz cd electric-fence-2.1.13/ make cd /opt/lib/gnu cp /prodotti/electric-fence-2.1.13/libefence.a . cd /prodotti \rm -r electric-fence-2.1.13/ tar zxpvf electric-fence_2.1.13-0.1.tar.gz text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:findremove?rev=1271061440&do=diff Main page Spesso il remove di file e directory viene guidato dal comando find. Questo opportunamente istruito seleziona gli oggetti da rimuovere. Dovendo eseguire un lavoro del tipo “elimina i file più vecchi di tot giorni” il comando è: find . -type f -mtime +tot -exec rm {} \; text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:ilo?rev=1271061440&do=diff Main Page ILO Vari sono gli oggetti provvisti di indirizzo ILO e quindi gestibili attraverso questo tool * front-end 10.1.1.100 * enclosure 10.1.1.10 (la vecchia, nella parte alta del rack) * blade 10.1.1.11 -> 26 (sono le blade “vecchie text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:istruzioni?rev=1271061440&do=diff Main Page [cluster:servizi:docs|Main Page]] Main Page Istruzioni per Wiki Formattazione * tutte le sezioni e sotto-sezioni iniziano per maiuscola * denominare le sezioni e sotto-sezioni in maniera “significativa” (che risponda al contenuto e lo riassuma in poche parole, facendo lo sforzo di mettersi dalla parte di chi legge senza conoscere l'argomento text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:lid?rev=1271061440&do=diff Questa è la tabella dei LID della varie blade. E' stata ottenuta applicando a tutte le blade il comando ibaddr. Sono riportati il nome della blade, il LID in formato decimale ed esadecimale. compute-0-0: 9 9 compute-0-1: 7 7 compute-0-2: 10 a text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:lvm?rev=1271061440&do=diff Configurazione dello storage con lvm2 Situazione 12 dischi ognuno da 500GB come di seguito divisi: 10 dischi (2 catene RAID5) 2 spare (1 per catena) lvm2 /home 200GB /data 900GB /scratch_gl 900GB 6 volumi fisici, 3 x catena dimensionati come sopra text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:materialstudio?rev=1271061440&do=diff Materials Studio 4.2 Installazione e configurazione scp /MaterialsStudio42UNIX_C12261.tgz andrea@tartaglia.units.it:/state/partition1/prodotti/MaterialsStudio/ MaterialsStudio42UNIX_C12261.tgz tar -xvzf MaterialsStudio42UNIX_C12261.tgz cp hpmpi... text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:mkl?rev=1271061440&do=diff Main Page Installazione MKL I prodotti Intel sono corredati dagli script di (dis)-installazione e le operazioni andrebbero fatte tramite quegli strumenti. In questo caso, non essendo più in possesso del materiale, la disinstallazione è stata fatta tramite: text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:nomipartizioni?rev=1271061440&do=diff Main Page Nomi partizioni locale (73 Giga) * /dev/cciss/c0d0p1 / ## 8 Giga (boot + root; immagine su /data/restore-images/root-backup-2007-07-04.iso.gz) * /dev/cciss/c0d0p2 /var ## 4 Giga (immagine su /data/restore-images/var-backup-2007-07-04.iso) text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:pgplot?rev=1271061440&do=diff pgplot installazione e configurazione cd /prodotti/ gunzip -c pgplot5.2.tar.gz | tar xvof - mv pgplot pgplot_src chown -R root:root pgplot_src mkdir pgplot cd pgplot cp /prodotti/pgplot_src/drivers.list . vi drivers.list e decommentate le righe x i drive: text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:prodotti?rev=1271061440&do=diff Prodotti amber materialstudio pgplot valgrind electric fence text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:shutboot?rev=1271061440&do=diff Main Page Shutdown e Reboot Allestire una postazione per root in sala macchine (monitor e tastiera sono su tavolino con ruote). Sia il monitor che la tastiera vanno opportunamente collegati al front-end; il monitor va allacciato all'alimentazione elettrica (la presa si trova sul retro del rack). text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:torquemaui?rev=1271061440&do=diff Main Page Torque PBS MAUI Installazione Configurazione Gestione Per conoscere lo stato dei nodi si può usare il comando: pbsnodes [nodo] se l'indicazione del nodo manca, viene mostrato lo stato di tutti i nodi. Se invece c'è il nome del nodo, l'output si riferisce a quello soltanto. Usare la notazione compute-0-X. text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:tripwire?rev=1271061440&do=diff Tripwire modifiche generata una nuova chiave con: /opt/tripwire/bin/twadmin --generate-keys --site-keyfile site.key (nota: passphrase vuota) cp site.key /opt/tripwire/etc/tartaglia.key x crittare i files /opt/tripwire/etc/tw.cfg e /opt/tripwire/etc/tw.pol con la nuova chiave: text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:utenti?rev=1271061440&do=diff Main Page Aggiungere utente Prima di procedere all'inserzione di un nuovo utente sono necessarie due informazioni: * quale UID attribuirgli * il gruppo di appartenenza Per separe quale UID (User IDentifier) dargli far girare lo script /root/script/maxuid text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:valgrind?rev=1271061440&do=diff Valgrind Installazione cd /prodotti wget <http://valgrind.org/downloads/valgrind-3.3.0.tar.bz2> mkdir valgrind cd valgrind mkdir gnu mkdir intel RAMO GNU module load openmpi/gnu cd /prodotti tar jvtf valgrind-3.3.0.tar.bz2 chown -R root:root valgrind-3.3.0 cd valgrind-3.3.0 CC=gcc CFLAGS=-O ./configure text/html 2010-04-12T08:37:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) https://docu.units.it/dokuwiki/servizi:cluster:yum?rev=1271061440&do=diff Main page Il repository locale è in /state/partition1/systemupdate/CentOS (e sottodirectory). Il mirror da cui attingere è quello del GARR. Come metodo tecnico si usa rsync tra repository esterno e locale. Lo script che effettua l'aggiornamento è /root/bin/systemupdate.sh